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Resolvendo lacunas epidemiológicas através do DATASUS usando RStudio
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Título
Resolvendo lacunas epidemiológicas através do DATASUS usando RStudio
Tipo de documento
Resumo
Descrição
Resumo apresentado na conferência anual da Guidelines International Network (GIN)
Fonte
GIN
Ano de publicação
2023
Referência (Vancouver)
Farinasso C, Ferreira VL, Rocha AP, Viscondi JYK, Marra LP, Oliveira LA, et al. Solving epidemiological gaps through DATASUS using RStudio. In: GIN Hybrid Conference Abstract Book; 2023 Sep 19-22; Glasgow, UK. G-I-N; 2023. p. 277.
Identificador
2023GIN017
Title
Solving epidemiological gaps through DATASUS using RStudio
Document type
Abstract
Description
Abstract presented at the Guidelines International Network (GIN) annual conference
Source
GIN
Publication year
2023
Reference (Vancouver)
Farinasso C, Ferreira VL, Rocha AP, Viscondi JYK, Marra LP, Oliveira LA, et al. Solving epidemiological gaps through DATASUS using RStudio. In: GIN Hybrid Conference Abstract Book; 2023 Sep 19-22; Glasgow, UK. G-I-N; 2023. p. 277.
Identifier
2023GIN017
Resumo
Contexto: No Brasil, recomendações para novas tecnologias dentro de uma determinada diretriz exigem avaliação de tecnologia em saúde, incluindo análise de impacto orçamentário (BIA). O departamento de tecnologia da informação (DATASUS) do Ministério da Saúde fornece tabulação de dados on-line no Sistema Único de Saúde (SUS). No entanto, é difícil analisar big data, especialmente para não estatísticos. Portanto, um pacote R pode facilitar estimativas sobre BIA. Então, cenários de caso base podem ser configurados, aos quais novas tecnologias podem ser comparadas, com base no número de pacientes e tipo de tecnologia já disponível. Objetivo: Ilustrar o uso do “Microdatasus”, um pacote R, para extrair e analisar dados brasileiros sobre pacientes com câncer de pulmão. Métodos: O pacote “Microdatasus” permite o download e processamento de arquivos do DATASUS. A função “Fetch_datasus” permite a seleção de cobertura de dados, lista de Unidades Federativas e outras informações de saúde. O Sistema de Informação Ambulatorial e o banco de dados de quimioterapia foram avaliados. Filtramos procedimentos e pacientes com câncer de pulmão por CID. Foram considerados dados de 2021. Resultados: Foram identificados 67.229 procedimentos relacionados à quimioterapia como tratamento para câncer de pulmão, totalizando 14.209 pacientes tratados com quimioterapias no Brasil em 2021. Segundo dados epidemiológicos, o número de pessoas tratadas por câncer de pulmão no SUS em 2021 seria de 22.741 (o que inclui todas as modalidades disponíveis). Discussão: Dados do mundo real de bancos de dados estruturados são uma importante fonte de informação para o desenvolvimento de diretrizes e têm o potencial de serem mais precisos do que estimativas epidemiológicas de cenários externos. O uso do RStudio para analisar dados do DATASUS garante praticidade e agilidade na manipulação de dados.
Notas
O registro foi originalmente publicado em inglês. A versão em português foi traduzida com o apoio de inteligência artificial.
Notes
The record was originally published in English. The Portuguese version was translated with the support of artificial intelligence.
Abstract
Background: In Brazil, recommendations for new technologies inside a certain guideline require health technology assessment, including budget impact analysis (BIA). The department of information technology (DATASUS) of the Ministry of Health provides online data tabulation on the Unified Health System (SUS). However, it is difficult to analyze big data, particularly for non statisticians. Therefore, a R package can facilitate estimations on BIA. Then, base-case scenarios might be setup, to which new technologies may be compared with, based on number of patients and type of technology already available. Objective: To illustrate the usage of “Microdatasus”, a R package, to extract and analyze Brazilian data regarding lung cancer patients. Methods: “Microdatasus” package allows downloading and processing of DATASUS files. “Fetch_datasus” function allows the selection of data coverage, list of Federative Units, and other health information. Ambulatory Information System and Chemotherapy database was assessed. We filtered lung cancer procedures and patients by ICD. We considered data from 2021. Results: A total of 67,229 procedures related with chemotherapy were identified as treatment for lung cancer, accounting for 14,209 patients treated with chemotherapies in Brazil in 2021. According to epidemiological data, the number of people treated for lung cancer in SUS in 2021 would be 22,741 (which includes all available modalities). Discussion: Real-world data from structured databases is an important source of information for guidelines’ development, and it has the potential of being more accurate than epidemiological estimates from external scenarios. The use of RStudio to analyze DATASUS data ensures practicality and agility in data manipulation.