-
PE-28 Modelagem de híbridos triazólicos derivados de produtos naturais e avaliação do perfil de interação em estrutura de HDAC2 por docking molecular
- Voltar
Título
PE-28 Modelagem de híbridos triazólicos derivados de produtos naturais e avaliação do perfil de interação em estrutura de HDAC2 por docking molecular
Tipo de documento
Resumo
Descrição
Resumo publicado no Jornal de Assistência Farmacêutica e Farmacoeconomia (JAFF)
Fonte
JAFF
Ano de publicação
2025
Referência (Vancouver)
Coutinho JVS, Damasceno KR, Morais PAB. PE-28 Modelagem de híbridos triazólicos derivados de produtos naturais e avaliação do perfil de interação em estrutura de HDAC2 por docking molecular. In: Anais do I Congresso Capixaba de Ciências Farmacêuticas; 2025 maio 16-17; Vitória, ES. J Assist Farmac Farmacoecon. 2025;10(Suppl 1).
Identificador
2025JAFF145
Title
PE-28 Modeling of Triazole Hybrids Derived from Natural Products and Evaluation of the HDAC2 Structure-Based Interaction Profile by Molecular Docking
Document type
Abstract
Description
Abstract published in the Journal of Pharmaceutical Care and Pharmacoeconomics (JAFF)
Source
JAFF
Publication year
2025
Reference (Vancouver)
Coutinho JVS, Damasceno KR, Morais PAB. PE-28 Modelagem de híbridos triazólicos derivados de produtos naturais e avaliação do perfil de interação em estrutura de HDAC2 por docking molecular. In: Anais do I Congresso Capixaba de Ciências Farmacêuticas; 2025 May 16-17; Vitória, ES. J Assist Farmac Farmacoecon. 2025;10(Suppl 1).
Identifier
2025JAFF145
Resumo
Introdução: As histonas desacetilases (HDACs) consistem em um grupo de enzimas responsáveis pelo desencadeamento de mecanismos metabólicos que corroboram para a modulação da cromatina, viabilizando o ciclo celular. Todavia, a super expressão dessas proteínas está relacionada com o desenvolvimento e agravo de uma série de patologias, sobretudo doenças neurodegenerativas e diferentes tipos de câncer. Mediante ao exposto, a busca por novos ligantes capazes de inibir HDACs surge como uma alternativa para a terapêutica em doenças como o Alzheimer, Parkinson, leucemias, linfomas e dentre outras. Objetivo: O objetivo do presente estudo consiste em modelar a estrutura de híbridos triazólicos derivados de produtos naturais, tendo como artifício teórico a técnica de “Click-Chemistry”, e avaliar o potencial de atividade biológica destes frente a isoforma 2 da enzima histona desacetilase (HDAC2), por meio de docking molecular. Material e Método: Inicialmente foi obtido o cristal da HDAC2, por meio do Protein Data Bank (Código PDB: 3MAX), sendo posteriormente limpo e demarcado quanto as coor-denadas de ancoramento (X: 48,9732; E: 15,6496; Z: -43,4309) no Biovia Discovery Studios 2024. Com o alvo molecular devidamente preparado, foi efetuada a modelagem dos híbridos triazólicos baseada na técnica de “Click-Chemistry” utilizando como estrutura teórica as azidas obtida da molécula de eugenol, e do ácido p-cumárico acetilado em sua hidroxila fenólica, e alcinos derivados de 6-hidroxi-flavonona, timol, eugenol, ácido p-cumárico, ácido cafeico e isatina, bem como o padrão 2-ami-no-N-(prop-2-en-1- il)benzamida, docado no cristal da estrutura supracitada. Sequencialmente, utilizou-se o sistema MCULE para a realização do redoking molecular, sendo os complexos alvo-ligantes, e as suas interações moleculares, visualizados por meio do BIOVIA Discovery Studios 2024. Resultados e Discussão: Todos os compostos modelados e analisados obtiveram um ΔG inferior a - 5, o que indica um perfil significativo de interação, com destaque para os triazóis formados mediante a hibridação teórica entre a azida derivada do eugenol, e o alcino oriundo da 6-hidroxi-flavonona, e a azida derivada do eugenol, e o alcino do próprio eugenol, com respectivos ΔG de - 8,2 Kcal/mol e - 6,4 Kcal/mol, ambos superiores ao padrão 2-amino-N-(prop-2-en--1-il)benzamida, que obteve - 5,4 Kcal/mol. Conclusões: Mediante ao exposto, torna-se notório o potencial de tais compostos na inibição da HDAC2, indicando a viabilidade na continuidade de testes in situ, in vitro e in vivo, visando sintetizar tais triazóis, e avaliar o comportamento desses em sistemas biológicos, sobretudo em modelos de doenças neurodegenerativas e tumorais.
Palavras-chave
Atividade biológica | Docking molecular | Química medicinal | Triazóis
Notas
O registro foi originalmente publicado em português. A versão em inglês foi traduzida com o apoio de inteligência artificial.
Abstract
Introduction: Histone deacetylases (HDACs) are a group of enzymes responsible for triggering metabolic mechanisms that contribute to chromatin modulation, enabling the cell cycle. However, the overexpression of these proteins is related to the development and aggravation of a series of pathologies, especially neurodegenerative diseases and different types of cancer. Therefore, the search for new ligands capable of inhibiting HDACs emerges as an alternative for therapy in diseases such as Alzheimer's, Parkinson's, leukemias, lymphomas, and others. Objective: The objective of this study is to model the structure of triazole hybrids derived from natural products, using the "Click-Chemistry" technique as a theoretical tool, and to evaluate their potential biological activity against histone deacetylase isoform 2 (HDAC2) through molecular docking. Materials and Methods: Initially, the HDAC2 crystal was obtained from the Protein Data Bank (PDB Code: 3MAX), and subsequently cleaned and demarcated according to its anchoring coordinates (X: 48.9732; E: 15.6496; Z: -43.4309) in Biovia Discovery Studios 2024. With the molecular target properly prepared, the modeling of triazole hybrids was carried out based on the "Click-Chemistry" technique, using as theoretical structures the azides obtained from the eugenol molecule and from p-coumaric acid acetylated at its phenolic hydroxyl group, and alkynes derived from 6-hydroxy-flavanone, thymol, eugenol, p-coumaric acid, caffeic acid, and isatin, as well as the standard 2-amino-N-(prop-2-en-1-yl)benzamide, docked in the crystal of the aforementioned structure. Subsequently, the MCULE system was used to perform molecular redoking, with the target-ligand complexes and their molecular interactions being visualized using BIOVIA Discovery Studios 2024. Results and Discussion: All modeled and analyzed compounds obtained a ΔG lower than -5, indicating a significant interaction profile, especially the triazoles formed by the theoretical hybridization between the azide derived from eugenol and the alkyne from 6-hydroxyflavonone, and the azide derived from eugenol and the alkyne from eugenol itself, with respective ΔG of -8.2 kcal/mol and -6.4 kcal/mol, both higher than the standard 2-amino-N-(prop-2-en--1-yl)benzamide, which obtained -5.4 kcal/mol. Conclusions: Based on the above, the potential of these compounds in inhibiting HDAC2 becomes evident, indicating the viability of continuing in situ, in vitro, and in vivo tests aimed at synthesizing these triazoles and evaluating their behavior in biological systems, especially in models of neurodegenerative and tumor diseases.
Keywords
Biological activity | Medicinal chemistry | Molecular docking | Triazoles
Notes
The record was originally published in Portuguese. The English version was translated with the support of artificial intelligence.