Desenvolvimento de um programa em Python para extração automatizada de dados na Biblioteca Cochrane: um estudo descritivo
Tipo de documento
Resumo
Descrição
Documento publicado na Rebrats (Rede Brasileira de Avaliação de Tecnologias em Saúde) que sintetiza informações, evidências e resultados de estudos ou avaliações em saúde, facilitando a compreensão e o acesso ao conhecimento científico.
Fonte
Rebrats
Ano de publicação
2023
Referência (Vancouver)
Gobi ELN, Zucchi P, Pacheco RL. Desenvolvimento de um programa em Python para extração automatizada de dados na Biblioteca Cochrane: um estudo descritivo. J Assist Farmac Farmacoecon. 2024;9(Suppl. 1).
Development of a Python Program for Automated Data Extraction from the Cochrane Library: A Descriptive Study
Document type
Summary
Description
A document published by Rebrats (Brazilian Network for Health Technology Assessment) that synthesizes information, evidence, and results from health studies or assessments, facilitating understanding of and access to scientific knowledge.
Source
Rebrats
Year of publication
2023
Reference (Vancouver)
Gobi ELN, Zucchi P, Pacheco RL. Desenvolvimento de um programa em Python para extração automatizada de dados na Biblioteca Cochrane: um estudo descritivo. J Assist Farmac Farmacoecon. 2024;9(Suppl. 1).
Introdução: A Biblioteca Cochrane é uma referência global no apoio à tomada de decisões em saúde en-globando ensaios e respostas clínicas. A síntese de vários estudos científicos de qualidade, selecionados por critérios de inclusão e exclusão, torna possível a elaboração de uma revisão sistemática. Atualmen-te, os estudos publicados no Cochrane Database of Systematic Reviews (CDSR) são disponibilizados virtualmente através da internet, sendo o meio pelo qual pesquisadores buscam, avaliam e selecionam esses estudos, para a elaboração de uma revisão sistemática. Entretanto, um dos fatores que leva à de-mora na seleção de estudos é ter que abri-los um por um dentro das palavras-chave, o que potencializa uma seleção quantitativamente menor. O presente estudo propôs o desenvolvimento de um programa de computador capaz de navegar por todo o CDSR e exportar parágrafos e todos os outros elementos dos estudos em um banco de dados estruturado e direcionado ao pesquisador. Métodos: O estudo foi conduzido no Núcleo de Avaliação de Tecnologias em Saúde (NATS) da Asso-ciação Paulista para o Desenvolvimento da Medicina (SPDM) e segmentado em duas partes, sendo a primeira o protótipo do programa de computador através de scripts nos navegadores Web e a última a consolidação do programa final, escrito na linguagem de programação Python e compatível com os principais sistemas operacionais do mercado.Resultados: Como teste final, o programa de computador desenvolvido foi capaz de extrair todos os nove mil artigos presentes no CDSR e exportá-los num banco de dados preparado para ser visualizado com programas de planilhas, como o Microsoft Excel. Com o sucesso, o núcleo aprovou o programa.Discussão e conclusões: O programa passou a ser utilizado como auxílio na seleção de estudos pelos pesquisadores do núcleo, os quais puderam solicitar as extrações com base em palavras-chave ou termos dispostos em quaisquer parágrafos dos textos dos estudos. A extração automática de todos os estudos presentes no CDSR levou cerca de um dia, sem requerer qualquer intervenção dos usuários, um tempo anteriormente tido como “impensável” pelos pesquisadores encarregados de fazer a busca manual dos estudos.
O registro foi originalmente publicado no idioma nativo em Português. As traduções foram geradas por inteligência artificial para o idioma Inglês.
Abstract
Introduction: The Cochrane Library is a global reference in supporting health decision-making, encompassing clinical trials and responses. The synthesis of several high-quality scientific studies, selected by inclusion and exclusion criteria, makes it possible to prepare a systematic review. Currently, studies published in the Cochrane Database of Systematic Reviews (CDSR) are made available virtually via the Internet, and are the means by which researchers search, evaluate and select these studies for the preparation of a systematic review. However, one of the factors that leads to delays in selecting studies is having to open them one by one using keywords, which potentially results in a quantitatively smaller selection. The present study proposed the development of a computer program capable of navigating the entire CDSR and exporting paragraphs and all other elements of the studies into a structured database directed to the researcher. Methods: The study was conducted at the Health Technology Assessment Center (NATS) of the São Paulo Association for the Development of Medicine (SPDM) and divided into two parts: the first was the prototype of the computer program using scripts in Web browsers, and the last was the consolidation of the final program, written in the Python programming language and compatible with the main operating systems on the market. Results: As a final test, the computer program developed was able to extract all nine thousand articles present in the CDSR and export them to a database prepared for viewing with spreadsheet programs, such as Microsoft Excel. With this success, the center approved the program. Discussion and conclusions: The program began to be used as an aid in the selection of studies by the center's researchers, who were able to request extractions based on keywords or terms displayed in any paragraph of the study texts. The automatic extraction of all studies present in the CDSR took about a day, without requiring any intervention by the users, a time previously considered "unthinkable" by the researchers in charge of manually searching for studies.
