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Vigilância laboratorial de COVID-19 e outros vírus respiratórios no DF: integração do controle de qualidade pela análise de dados de RT-PCR
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Título
Vigilância laboratorial de COVID-19 e outros vírus respiratórios no DF: integração do controle de qualidade pela análise de dados de RT-PCR
Tipo de documento
Resumo
Descrição
Resumo apresentado no Simpósio de Saúde Baseada em Evidências (SISBE)
Fonte
SISBE
Ano de publicação
2025
Referência (Vancouver)
Paula EH, Murtadha F, Costa TP, Yamada FGOA, Silva GA, Costa FJQ. Vigilância laboratorial de COVID-19 e outros vírus respiratórios no DF: integração do controle de qualidade pela análise de dados de RT-PCR. In: Simpósio de Saúde Baseada em Evidências 2025 [Internet]. Brasília (DF): Fundação de Ensino e Pesquisa em Ciências da Saúde; 2025. Disponível em: https://repositoriobce.fepecs.edu.br/handle/123456789/1607
Identificador
2025SISBE016
Title
Laboratory surveillance of COVID-19 and other respiratory viruses in the Federal District: integration of quality control through RT-PCR data analysis
Document type
Abstract
Description
Abstract presented at the Evidence-Based Health Symposium (SISBE)
Source
SISBE
Publication year
2025
Reference (Vancouver)
Paula EH, Murtadha F, Costa TP, Yamada FGOA, Silva GA, Costa FJQ. Vigilância laboratorial de COVID-19 e outros vírus respiratórios no DF: integração do controle de qualidade pela análise de dados de RT-PCR. In: Simpósio de Saúde Baseada em Evidências 2025 [Internet]. Brasília (DF): Fundação de Ensino e Pesquisa em Ciências da Saúde; 2025. Available from: https://repositoriobce.fepecs.edu.br/handle/123456789/1607
Identifier
2025SISBE016
Resumo
INTRODUÇÃO: No Distrito Federal (DF), a elevada incidência de infecções respiratórias agudas gera pressão considerável sobre os serviços de saúde e impacta a população, tornando essenciais o diagnóstico ágil e ações de controle eficazes. Os testes de RT-PCR, "padrão-ouro" no diagnóstico, para múltiplos Vírus Respiratórios (VRs) como: Influenza A (FluA); Influenza B (FluB); o SARS-CoV-2 (COVID-19); Adenovírus (ADV); Rinovírus (HRV) e Vírus Sincicial Respiratório (VSR/VRS) é essencial, mas sua efetividade depende da integridade de toda a cadeia processual, desde a coleta da amostra até a interpretação do resultado. Erros em qualquer fase, desde a coleta inadequada até falhas na amplificação ou interpretação, podem comprometer a fidedignidade dos dados. Dessa forma, todas as etapas deste processo devem ser constantemente monitoradas e padronizadas, evitando erros. Este estudo visa gerar evidências para otimizar esse processo na Rede Pública de Saúde do DF, integrando o controle de qualidade laboratorial com a análise aprofundada dos dados de RT PCR e seu contexto, fortalecendo a tomada de decisão baseada em dados confiáveis. OBJETIVOS: Fortalecer a VLE de COVID-19 e outros VRs na rede pública do DF através da integração do controle de qualidade (CQ) pela análise de dados de RT-PCR, com os seguintes objetivos: Avaliar a qualidade amostral utilizando o gene controle RP; 2) Monitorar os controles de RT-PCR; 3) Analisar os valores de CT dos alvos virais como ferramenta para verificação de interpretação clínica; 4) Utilizar os dados de CQ derivados da RT-PCR para otimizar as etapas críticas no fluxo da vigilância laboratorial. MÉTODO: Visando fortalecer a vigilância de VRs no Distrito Federal, realizamos um estudo observacional analítico focado na integração do controle de qualidade (CQ) por meio da análise criteriosa dos dados de RT-PCR. Investigamos os resultados do Painel Respiratório Viral (VRs citados) processados no LACEN-DF, oriundos de mapas de trabalho completos de abril de 2025, selecionados aleatoriamente para garantir representatividade. A avaliação do CQ foram derivados diretamente dos dados da RT-PCR: a análise do gene controle endógeno RNase P (RP) serviu para verificar a qualidade da amostra e da extração genômica, etapa crucial para resultados fidedignos; controles positivo e negativo validaram cada corrida analítica; e a análise dos valores de CT dos vírus detectados auxiliou na caracterização do perfil epidemiológico. Todos os resultados foram tratados de forma segura e anonimizada. Para compreender o processo em sua realidade prática, mapeamos o fluxo de trabalho no laboratório – desde a coleta da amostra até a emissão final do laudo. Esse mapeamento visou identificar fontes potenciais de erro e os pontos críticos do exame. A análise dos dados quantitativos (médias e desvios padrão dos CTs) empregou estatística descritiva. O propósito desta abordagem metodológica é gerar subsídios baseados em evidências para o aprimoramento contínuo dos processos, fortalecendo assim a robustez da vigilância laboratorial de vírus respiratórios no DF. RESULTADOS: A análise dos dados de 150 amostras de pacientes (2 mapas de trabalho) mostrou ser sólida e confiável para a VLE, indicando consistência nos principais pontos de CQ avaliados neste estudo. A segurança dos dados de VLE foi a demonstração da qualidade das amostras recebidas e processadas: observamos 100% de detecção de RP, com valor médio de CT de 25,0 (DP ±2,6), que é relevante por assegurar a representatividade do material biológico e a eficiência da coleta da amostra naso-faríngea e etapa de extração, minimizando assim o risco de subnotificação por resultados falso-negativos que poderiam comprometer a precisão da VLE. Os controles positivo e negativo, incluídos como padrão em todas as corridas analíticas apresentaram os resultados esperados, confirmando a validade técnica de cada ensaio e a confiabilidade na detecção (ou não detecção) dos alvos virais em cada amostra. O mapeamento do fluxo de trabalho permite identificar etapas críticas – como o transporte de amostras e a triagem inicial no laboratório. Finalmente, a estratificação dos valores de CT dos vírus detectados (positividade de 65% nos mapas analisados) pode indicar: alta, média ou baixa carga viral; e que pode vir a ser um parâmetro valioso e informativo no laudo. Essa análise agrega uma dimensão semi-quantitativa aos dados da VLE, que pode auxiliar na interpretação da dinâmica e intensidade de transmissão viral na comunidade aprimorando a segurança e a qualidade final do processo laboratorial. DISCUSSÃO E CONCLUSÕES: A integração do CQ pela análise dos dados da rotina de RT-PCR demonstra ser uma estratégia segura na VLE de Covid-19 e outros VRs. A análise conjunta de indicadores chave – como o gene RP para atestar a qualidade amostral, os controles que validam a execução analítica, e a distribuição dos valores de CT que oferece indicativos epidemiológicos e de coerência dos resultados, quando contextualizada pelo mapeamento dos processos do serviço, cria um sistema de CQ mais seguro, dinâmico e informativo. Embora esta análise represente um retrato do período de abril de 2025, os achados reforçam que tal abordagem integrada, alimentada pelos próprios dados laboratoriais, fortalece substancialmente a qualidade e a credibilidade da VLE de Covid-19 e outros VRs na Rede Pública do DF. Informações mais seguras e úteis são essenciais para subsidiar decisões e ações de Saúde Pública mais eficazes e adequadas ao nosso contexto local, contribui para respostas mais efetivas na VLE das doenças respiratórias.
Notas
O registro foi originalmente publicado em português. A versão em inglês foi traduzida com o apoio de inteligência artificial.
Abstract
INTRODUCTION: In the Federal District (DF), the high incidence of acute respiratory infections places considerable pressure on health services and impacts the population, making rapid diagnosis and effective control measures essential. RT-PCR tests, the “gold standard” for diagnosis of multiple respiratory viruses (RVs) such as Influenza A (FluA), Influenza B (FluB), SARS-CoV-2 (COVID-19), Adenovirus (ADV), Rhinovirus (HRV), and Respiratory Syncytial Virus (RSV), are essential; however, their effectiveness depends on the integrity of the entire process chain, from sample collection to result interpretation. Errors at any stage, from improper collection to amplification or interpretation failures, may compromise data reliability. Therefore, all steps in this process must be continuously monitored and standardized to avoid errors. This study aims to generate evidence to optimize this process in the public health network of the DF, integrating laboratory quality control with in-depth analysis of RT-PCR data and its context, strengthening data-driven decision-making. OBJECTIVES: To strengthen laboratory surveillance (VLE) of COVID-19 and other RVs in the public health network of the DF through the integration of quality control (QC) via RT-PCR data analysis, with the following objectives: 1) Evaluate sample quality using the RP control gene; 2) Monitor RT-PCR controls; 3) Analyze CT values of viral targets as a tool for clinical interpretation; 4) Use RT-PCR-derived QC data to optimize critical steps in the laboratory surveillance workflow. METHOD: To strengthen RV surveillance in the Federal District, we conducted an observational analytical study focused on integrating quality control (QC) through detailed analysis of RT-PCR data. We investigated results from the Viral Respiratory Panel (VRs mentioned) processed at LACEN-DF, derived from complete work maps from April 2025, randomly selected to ensure representativeness. QC evaluation was directly derived from RT-PCR data: analysis of the endogenous control gene RNase P (RP) was used to verify sample quality and genomic extraction efficiency, a crucial step for reliable results; positive and negative controls validated each analytical run; and analysis of CT values of detected viruses helped characterize the epidemiological profile. All results were processed securely and anonymized. To understand the process in its practical reality, we mapped the laboratory workflow—from sample collection to final report issuance. This mapping aimed to identify potential sources of error and critical points in the assay. Quantitative data analysis (means and standard deviations of CT values) used descriptive statistics. This methodological approach aims to generate evidence-based inputs for continuous process improvement, thereby strengthening the robustness of respiratory virus laboratory surveillance in the DF. RESULTS: Analysis of data from 150 patient samples (2 work maps) showed a solid and reliable system for laboratory surveillance (VLE), indicating consistency in the main QC points evaluated in this study. Data reliability in VLE was demonstrated by the quality of samples received and processed: we observed 100% RP detection, with a mean CT value of 25.0 (SD ±2.6), which is relevant as it ensures representativeness of biological material and efficiency of nasopharyngeal collection and extraction steps, minimizing the risk of underreporting due to false-negative results that could compromise VLE accuracy. Positive and negative controls included as standard in all analytical runs showed expected results, confirming the technical validity of each assay and the reliability of viral target detection (or non-detection) in each sample. Workflow mapping allowed identification of critical steps such as sample transport and initial laboratory triage. Finally, stratification of CT values of detected viruses (positivity of 65% in analyzed maps) may indicate high, medium, or low viral load and may serve as a valuable semi-quantitative parameter in reporting. This analysis adds a semi-quantitative dimension to VLE data, supporting interpretation of viral transmission dynamics and intensity in the community, improving overall safety and quality of the laboratory process. DISCUSSION AND CONCLUSIONS: Integration of QC through RT-PCR routine data analysis proves to be a safe strategy for COVID-19 and other RV laboratory surveillance. The combined analysis of key indicators—such as the RP gene for sample quality, controls validating analytical execution, and CT value distribution providing epidemiological and result coherence insights, when contextualized by workflow mapping—creates a more robust, dynamic, and informative QC system. Although this analysis represents a snapshot of April 2025, the findings reinforce that such an integrated approach, driven by laboratory data itself, substantially strengthens the quality and credibility of COVID-19 and other RV surveillance in the DF public health network. More reliable and useful information is essential to support more effective and appropriate public health decisions and actions in the local context, contributing to more effective responses in respiratory disease surveillance.
Notes
The record was originally published in Portuguese. The English version was translated with the support of artificial intelligence.